Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms