Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rab11fip1Q9D620 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rab11fip1Q9D620 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rab11fip1Q9D620 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rab11fip1Q9D620 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rab11fip1Q9D620 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip1Q9D620 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rab11fip1Q9D620 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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