Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D5Q8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms