Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn11Q9D572 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms