Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q6

Erp44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp44Q9D1Q6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Erp44Q9D1Q6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Erp44Q9D1Q6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms