Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hddc3Q9D114 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms