Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnajc18Q9CZJ9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms