Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snf8Q9CZ28 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms