Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ctnnbl1Q9CWL8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctnnbl1Q9CWL8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms