Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhobtb3Q9CTN4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms