Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PompQ9CQT5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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PompQ9CQT5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PompQ9CQT5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PompQ9CQT5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PompQ9CQT5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PompQ9CQT5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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