Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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