Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atoh8Q99NA2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms