Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnf17Q99MV7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf17Q99MV7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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