Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprtQ99M80 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms