Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Sh3bp5lQ99LH9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Sh3bp5lQ99LH9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Sh3bp5lQ99LH9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp5lQ99LH9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms