Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pagr1aQ99L02 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms