Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ciao1Q99KN2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms