Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mcoln1Q99J21 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms