Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx9Q91VH2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx9Q91VH2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms