Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fyco1Q8VDC1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms