Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms