Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rab11fip5Q8R361 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rab11fip5Q8R361 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms