Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc12Q8R344 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms