Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MyripQ8K3I4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms