Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rassf9Q8K342 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rassf9Q8K342 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms