Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms