Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc12Q8K2L8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Trappc12Q8K2L8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Trappc12Q8K2L8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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Trappc12Q8K2L8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc12Q8K2L8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Trappc12Q8K2L8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms