Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Fbxo18Q8K2I9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Fbxo18Q8K2I9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Fbxo18Q8K2I9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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Fbxo18Q8K2I9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fbxo18Q8K2I9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fbxo18Q8K2I9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms