Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek9Q8K1R7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms