Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopaQ8CIE6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms