Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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