Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A430089I19RikQ8C9W1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A430089I19RikQ8C9W1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms