Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ubqln3Q8C5U9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ubqln3Q8C5U9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ubqln3Q8C5U9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ubqln3Q8C5U9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ubqln3Q8C5U9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ubqln3Q8C5U9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ubqln3Q8C5U9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ubqln3Q8C5U9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ubqln3Q8C5U9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ubqln3Q8C5U9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ubqln3Q8C5U9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubqln3Q8C5U9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubqln3Q8C5U9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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