Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sfrp1Q8C4U3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sfrp1Q8C4U3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sfrp1Q8C4U3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sfrp1Q8C4U3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sfrp1Q8C4U3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sfrp1Q8C4U3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms