Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FarsaQ8C0C7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FarsaQ8C0C7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FarsaQ8C0C7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FarsaQ8C0C7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FarsaQ8C0C7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FarsaQ8C0C7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FarsaQ8C0C7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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