Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms