Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx17Q8BVL3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms