Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nlrp4aQ8BU40 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nlrp4aQ8BU40 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms