Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms