Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Grik4Q8BMF5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik4Q8BMF5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms