Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gtf3c2Q8BL74 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c2Q8BL74 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms