Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms