Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE4

Susd6, Sushi domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd6Q8BGE4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd6Q8BGE4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms