Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ChfrQ810L3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ChfrQ810L3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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