Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q80Y73 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q80Y73 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q80Y73 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q80Y73 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q80Y73 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q80Y73 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q80Y73 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q80Y73 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q80Y73 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q80Y73 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q80Y73 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q80Y73 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q80Y73 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q80Y73 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms