Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pcsk9Q80W65 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pcsk9Q80W65 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pcsk9Q80W65 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pcsk9Q80W65 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pcsk9Q80W65 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pcsk9Q80W65 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pcsk9Q80W65 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Pcsk9Q80W65 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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