Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC30.32■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC30.32■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC30.32■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.45
NischQ80TM9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
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