Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms