Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih3Q6ZWS4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnih3Q6ZWS4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms